名侦探柯南剧情介绍
工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑衣人的下落。
酒会现场发生山崎总经理被害事件。解决这个事件的是以福尔摩斯式的推理能力而声名大噪的高中生侦探——工藤新一。某天，新一和自己青梅竹马的同班同学毛利兰相约到游乐场游玩时，意外的在云霄飞车上遇到了杀人事件，在新一的推理下，很快协助警方破了这个案子。不过，这时有两个黑衣人的身影进入了新一的视线……
在现场目击黑衣男子犯罪的新一遭袭击昏迷，并被强灌不知名的药。这是尚未研制成功的神秘毒药，导致新一身体神奇般的变小了，求助邻居阿笠博士，阿笠博士又将他委托给了－－担心新一是否回家而过来询问的小兰照顾。也因此，他帮助兰的父亲：毛利小五郎顺利的侦破了他半年来的第一件工作——“董事长千金绑架事件”。
阿笠博士发明了可以任意变换声音的蝴蝶领结变声器交给柯南。小五郎也接到了自己所崇拜的偶像歌星冲野洋子的委托，对近期发生在自己身边的骚扰事件进行调查。但是，却意外地发现洋子所住的房间里躺着一具死尸……
柯南、步美、元太、光彦一行人去参观东都美术管的世界宝物展。元太在美术馆前面，捡到一张画着暗号的地图，大家一致认为那是张藏宝图，经过柯南的推理及一波三折的寻找后，终于找到了金币的藏匿点。但是，此时意大利的强盗集团也出现了，称那些金币属于他们，柯南他们也因此陷入了危机……
小五郎去京都准备参加朋友的婚礼。在新干线列车内柯南窃听了黑衣男子的对话、听见与他们将放有设定炸弹的箱子交给了与他们交易的人，并将在那个人不知情的情况下会引爆炸！这会是一班驶向地狱的列车吗？
“一年一度的情人节又到了，小兰接到同学铃木园子的邀请参加情人节的宴会，没想到又遇到了杀人事件，在柯南的推理之下，找出了真正的凶手，而小兰所准备的巧克力并没有送出去，因为那是为新一所准备的。
小川医生这两年来不断收到未署名的钱和玩具，实在是不知道来历，所以前往毛利侦探事务所求助。在柯南的推理之下，于千钧一发之际成功解救了小川医生的孩子。但是，小兰却开始怀疑起柯南的真实身份了……
“城中美术馆冒出中世纪盔甲会自己走路的传闻，引起了小兰浓厚的兴趣，打算一探究竟，没想到却意外地发现美术馆在一周后即将关闭，更加意外的是，未来的美术馆所有者竟然被杀了，又是一桩扑朔迷离的杀人事件…… ”
毛利一行人前往埼玉县观赏天下第一夜祭活动，突然有一名自称世井的作家，请小兰替他拍照，而他正是四十几分钟前，一桩枪杀案的嫌疑犯。但是他却拥有完美的不在场证明的照片，这是怎么一回事呢？
一天，一个自称是新一女朋友的女孩量子前往毛利侦探事务所，此举引起了小兰极大的反感。其实量子是因为受委托看护的著名足球选手赤木英雄的弟弟：赤木守被绑架，但是又迫于绑匪的压力，不敢惊动警察，才出此下策的……
奇妙的委托函送到小五郎处。委托人声称为“月影岛的麻生圭二”的人物。但是当小五郎等到月影岛去查看时，得知麻生圭二其人是已于12年前死去的钢琴家。他们为了详细调查当时的关系人到公馆里问话，但那里却有数位岛上的资产家被杀。而且，还是在麻生圭二至死时所弹的“月光”的音乐声中……恐怖、悠扬的钢琴乐声在月影岛上响起，神秘的复仇行动就此展开！
奇妙的委托函送到小五郎处。委托人声称为“月影岛的麻生圭二”的人物。但是当小五郎等到月影岛去查看时，得知麻生圭二其人是已于12年前死去的钢琴家。他们为了详细调查当时的关系人到公馆里问话，但那里却有数位岛上的资产家被杀。而且，还是在麻生圭二至死时所弹的“月光”的音乐声中……恐怖、悠扬的钢琴乐声在月影岛上响起，神秘的复仇行动就此展开！
柯南和步美他们一起玩捉迷藏的游戏，步美躲在一辆车的后车厢中，没想到竟然睡着，元太一直都找不到步美，最后柯南终于用无线电和她联络上，但步美却在车的后备箱中发现了一个人头，刚好此时有件连续绑架少女杀人事件，柯南怀疑那辆车的两个男人，就是那个事件的歹徒……
报纸刊出有关十亿元的抢劫事件之后不久，毛利侦探事务所来了一位自称广田雅美的女学生，请求寻找她的父亲广田健三。当毛利找到这位父亲后，隔天却发现广田健三死了，这到底是怎么一回事？与此同时还有另外一位高大男人，也请求另一名戴墨镜的侦探，寻找广田健三，但是，他们所说的背景却都不一样，两者之间有什么联系吗？
柯南和步美他们一起在河边玩耍，结果目击到一件狙击事件：有人用来复枪射击湖面模型快艇带动的气球。当柯南到达对岸废弃楼房的楼顶时，却捡到了一个记录有一连串神秘数字的计算器……
少年侦探团为了要寻找一只猫，而无意中闯进一幢公馆中，结果却在浴室中发现一具尸体，他们立刻通知警方，可是，警方到达现场后，尸体却神秘失踪了……
毛利小五郎受古董收藏家丸传次郎之托，调查他太太丸稻子是否有外遇。结果遇到传次郎有客人来拜访，但是，两三个小时过去了，仍然不见传次郎的踪影……
少年侦探团到商场看假面超人秀。在回去的路上，元太为了拿回忘在商场里的假面超人签名，被关在了已经打烊的店里。谁知人潮已散去，外表看似寂静的百货公司实际上却一点也不安静。戴著面具的人偶挟持了警卫和工作人员，看似单纯的强盗事件，幕後竟还有共犯，遇上了强盗集团的少年侦探团正陷入极度的危险之中……
柯南和小兰一起去参加初中老师的婚礼，没想到婚礼还没有开始，老师就被人蓄意下毒而生命垂危。松元老师有一个习惯，就是非常喜欢喝柠檬茶，因为那是她小时候的初恋情人，最常拿给她喝的饮料。在柯南的推理下，最后终于让凶手现出原形，但是却也道出了一段令人心酸的往事……
工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探对，向罪犯宣战！
步美某日经过传说中的鬼屋，而且还看到屋内有鬼火，于是了到鬼屋探险的念头，便和柯南、光彦还有元太一起出动。这个传说中的鬼屋，因为屋主被杀后，其它的家人就突然间不知去向，于是许多闹鬼的传说就此传开……
毛利小五郎担任某一侦探连续剧的顾问，由于剧情需要一行人前往米花神社拍外景。可是摄影助手安西却利用偷拍照片私下对工作人员进行要挟，令大家很反感，可是，深夜他竟然被人杀死在米花神社了。
毛利三人因阴错阳差搭上了旗本家族包下的豪华客轮离开度假的荒岛。船上除了毛利三人外，就是旗本一家人以及一位管家共十人。晚餐时，旗本家的豪藏老爷却在自己的房间中被人杀害了，大家怀疑是入赘的次孙女婿武因报家仇而杀人，并将其软禁；接着入赘的长孙婿：龙男也被人残忍地杀死在船甲板上，而被囚禁的武却不知所踪……
然而航行中却发生了连续杀人案件，凶手就在船上，但是船上的人竟全是同一家族，什么原因引发杀机，是世代恩仇或是庞大财产的诱惑？旗本一家人开始互相猜忌，攻击指责家人的种种隐私，但就在这时，长孙一郎也在洗手间内遭到凶手的袭击，遇刺受伤了……在这艘豪华游船上，暴露了世代恩怨与庞大家族财产交织出的人性最黑暗的一面！
小五郎以前逮捕的嫌疑犯从看守所里逃狱了。犯人会狙杀小五郎吗？小兰和柯南为此特意保护小五郎。这时他们遇上了一位失忆的女子。
小兰的同学被绑架了。犯人要求5亿元的赎金，而被绑架的直子的父亲却出不了这么多钱。这时直子被绑架时所乘的车子被发现沉在了海里。
跟新一从小就很熟的狗约翰在主人坂口不在时咬死了人。柯南开始推理约翰为何会咬死人……经过调查……柯南发现这原来是一个利用狗来做杀人工具的阴险杀人事件。
小五郎带着兰和柯南去参加大学同学会。他们约好去看烟花大会，在中途回到旅馆时，小五郎的同学已经头部中枪死亡了。死去的是同在旅馆参加同学会的由美。
乍看之下像是自杀，但小五郎和柯南发现可能是他杀而重新推理。小五郎誓称要找出凶手！欢乐的聚会中，暗藏杀机，情爱的纠葛造成终生的悔恨……
大木田社长在睡眠之中心脏病发死亡。因为头一天小五郎送过大木田名片，于是他带着小兰、柯南去了大木田家。
巽氏律师雇用毛利侦探来调查妻子的外遇，整个事件展开调查时，却传来巽氏律师妻子遭人杀害的消息。可疑的巽氏律师有充分不在场证明，整个案件貌似陷入胶著状态。但是柯南却发现，这件看似天衣无缝的完美杀人事件中，留下足以致命的破绽－－案件发生时巽氏正和小五郎等人会面，而巽氏妻子外遇的对象却在那前后到过巽氏家。
毛利小五郎被电视台邀请为嘉宾，参与制作现场直播的侦探节目。当节目播完后，却发现这家电视台的制作人——诹访道彦离奇死亡，而嫌疑最大的人就是节目的主播松尾贵史。但是录制节目的场地在9楼，死亡地点在4楼，松尾贵史在录制节目期间只离开了4分钟，他究竟是怎样做到的呢？柯南开始了他的侦察……
兰谎称与新一约会出门去了。柯南为此特意跟踪兰到了咖啡厅。正当他在猜想和兰约会的人是谁时，又一个杀人事件发生了……而与柯南“并肩作战”的竟是兰的母亲——妃英理。
博士送给少年侦探团一张藏宝图，侦探团开始寻宝。在山中探险时遇到了可疑的2人组。侦探团越过重重阻碍，终于在那2人之前找到了这个神秘的宝藏……
到园子家别墅玩的小兰和柯南在别墅前见到一个包着绷带的恐怖人物。在别墅里聚会的是园子的姐姐绫子大学里的小组同伴们。
此后一连串的杀人事件陆续发生，园子的姐姐绫子大学里的小组同伴们中的知佳子被杀了，小兰也遭到了袭击！所有对外联络管道也全遭破坏，柯南一行人如何脱离险境……风光明媚的度假别墅，暗藏危险的复仇计划！绷带男子究竟是什么人？
步美去牙医泽木叶子那里拔牙。晚上七点半时发生了杀人事件。第一发现者是给步美治牙的医生。虽然调查发现这位牙医有动机，但步美却成了她不在场的证明……
有位名叫冈谷纪子的女子来拜访小五郎的事务所。她委托小五郎寻找她在旅行时遇到的北川先生，并且带来了画像。看到画像的柯南产生了疑问，于是到冈谷家进行调查。
小五郎受托跟踪某个男子。次日从新闻中听到，所跟踪的男子被火烧死了。调查发现，委托跟踪的人和被害者是相识二十多年的老友，他们之间有一个关于5亿元保险金的赌。数十年朋友的情谊，终抵不过巨额金钱的诱惑……
四井集团会长为独生女丽花办生日派对，场地在郊外的豪华别墅，毛利以贵宾身份，带柯南、小兰一同出席。小五郎、小兰和柯南参加完派对要回去时，客人们的几辆汽车突然爆炸了。因此小五郎等人和会长千金一起留在别墅里。
此后，丽花不见了，然后又发现了二阶堂被溺死的尸体。小五郎和柯南发现了失踪了的丽花的溺死的尸体。这时，小兰又遭到了袭击。凶手是谁？究竟是用何种手法连续犯案的？生命转动轮回的序曲，善因恶果终将降临……
小五郎长去的一家饮食店老板的儿子参加了棒球比赛。小五郎、小兰、柯南去给他加油。这时，修好学园地区大赛的优胜锦旗不知被什么人割裂了，校长说要退出比赛，小五郎能否找出犯人？
园子获得可以和超人气组合REX一起唱卡拉OK 的机会。小兰和柯南也受邀一同前去，但卡拉OK唱完后，REX的主唱木村达也却被毒死了。
一位自称柯南母亲的妇人，到侦探事务所要带柯南回家，但她不是柯南的妈妈！是带假面的黑衣男子的同伙吗？柯南虽然知道是骗局，又碍於毛利和小兰而不敢揭穿，只好随着妇人离去。在无意中偷听到这对神秘男女的不法勾当和手上握有恢复柯南原形的解药……若隐若现的神秘解药，柯南展开冒险侦察行动!
因为恰好路过的小小五郎帮助了车子坏掉的崛田重工的社长崛田氏，他们被招待去崛田的别墅。然后，去查看突然的爆炸声的崛田死去了。
吃完饭要回家的小五郎因为车子被撞坏了，便打手机给司机泉武雄。没想到接电话的却是目暮警部。泉和小小五郎被叫到现场，看到一位已经死去的女性……
小兰一行人去滑雪。因为他们不小心丢了租的别墅的钥匙，便到外科教授大山将的别墅借宿。因为在房间看电视的大山教授一直没有回来，众人去看时，大山教授已经被残忍的杀害了……
柯南等被选中成为运动俱乐部的嘉宾客人。当晚他们接到目暮警部录在的答录机里的电话，因此前往运动俱乐部免费娱乐。其间柯南目睹了西条直也与成濑、木岛以及俱乐部主席佐伯丽子的争执。当晚，西条就被杀害了，凶手到底是谁？柯南在目击证人画下的西条的最后一跳中发现了破绽……
突然有个叫服部平次的关西人来到小五郎的事务所。这时正好有委托人上门。当大家到达委托人家时，主人达村外交官已经死了。服部平次收集了密室杀人的证据并据此推理。柯南因为重感冒倒下了。
服部平次用推理逼出凶手。虽然连凶手自己也承认了，但突然有声音说：“不对，凶手不是他！”——说这话的人竟然是新一！新一指出了服部的推理错误，揭示了真正的凶手。可是，在这之后，工藤新一又一次消失了……
少年侦探团到米花图书馆看书，正好遇到来搜查失踪的馆员玉田的目暮警部。在馆内没有搜到玉田，少年侦探团夜里偷偷潜入寻找玉田，结果却发现了玉田的尸体。充满诡谲的图书馆中到底隐藏什麼秘密？正当他们无意中发现图书馆馆长的阴谋，准备揭发其罪行时竟遭到追杀……这会是江户川柯南的最后一个案件吗？
小五郎被冲野洋子推荐参加高尔夫球比赛。为此小五郎特地一大早到高尔夫球场练习。练习中突然有爆炸声，有一个一直在旁边练球的公司职员被炸死了。
柯南、小兰与毛利小五郎一起去赏樱花，却因故借宿在一间寺庙里。寂静的寺庙中，传说有妖怪--雾天狗出没。果然，庙寺的住持，隔天被发现吊死于房中，由于死亡的方式非一般凶手所能做到，更使整个案情陷入迷雾。和尚的死法简直就像被雾天狗杀死一样，对自杀的观点保有怀疑态度的柯南，准备迎接这个天大诡计的挑战……古老的传说加上鬼怪悬疑的寺庙，其中到底有何不为人知的秘密……
柯南、小兰与毛利小五郎一起去赏樱花，却因故借宿在一间寺庙里。寂静的寺庙中，传说有妖怪--雾天狗出没。果然，庙寺的住持，隔天被发现吊死于房中，由于死亡的方式非一般凶手所能做到，更使整个案情陷入迷雾。和尚的死法简直就像被雾天狗杀死一样，对自杀的观点保有怀疑态度的柯南，准备迎接这个天大诡计的挑战……古老的传说加上鬼怪悬疑的寺庙，其中到底有何不为人知的秘密……
柯南与小兰、小五郎在悠闲散步时听到了惨叫声，赶去声音传来的公寓看时，却发现井本氏已经在阳台上死了……
满天堂公司制作了“毛利小五郎 推理之馆”的游戏并由小五郎监制，同时邀请参加在米花饭店召开的新作发表会。热闹的会场突然发生爆炸，并且有人当场遇害，柯南亲眼目睹爆炸过程，且无意间发现追查已久的黑衣组织成员也涉案其中。满目疮痍的会场，烟雾弥漫，柯南能拨开迷雾查出真相吗？
小五郎等人参加完温泉旅行乘电车回来时，旁边坐席上正好是住在同一饭店的医生团体游客中的两人。等待换乘电车的一端时间里，其他车厢里有个男人被杀了。
清洁公司的董事藤井被杀了。正好在现场附近的柯南等赶去查看。小五郎和目暮警部也一同在调查清洁公司。凶手杀人的手法到底是什么？
柯南入选福尔摩斯迷聚会，同小五郎、小兰一同前去。到了旅馆却发现参加者中还有服部平次。第二天，策划聚会的金谷连车坠入海中。紧接着参加者大木也被杀害了！
紧接着参加者大木也被杀害了！旅馆又出现了牺牲者！柯南等开始推理。看到正在推理的柯南，平次怀疑他是否真的就是新一。柯南的真实身份是否会穿帮？凶手究竟是谁？
米花町举行了“首次跑腿”大赛。少年侦探团作为记录者也参与其中，任务是追随步美家附近的阿宏。阿宏不知被什么人狙击，然后就失踪了。
画家花冈要出画集了。因为打算在卷末登载与小五郎的对谈，于是请小五郎来到他的设计事务所。花冈终于到来时，对面公寓住的蝶野小姐从公寓楼上坠楼身亡了。
少年侦探团跟阿笠博士一起去电影“哥梅拉”的拍摄现场，由博士的朋友带着参观。这时，哥梅拉的演员被刀刺伤，电影制作人被哥梅拉杀死，柯南看透了案件的真相……
小五郎杀害灯台职员滨田的嫌疑被柯南洗脱了。柯南到了一个岛上的人都不接近的水军洞窟，跟岛上的一个女孩子一同进入时，发现里面有具男人的尸体！
工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探对，向罪犯宣战！
大叔被叫去前辈寺冈警部家中。他们在庭院中享受烧烤时，寺冈的手机响了，对方声称杀了集团的干部。寺冈要劝其自首，小五郎也一同前去。可是当小五郎到达时，却发现对方已死亡，据寺冈所说那人是死于意外……真的是这样吗？这起看似意外的死亡事件，背后实际隐藏着丑陋的内幕！
小五郎等人到饭店吃饭。柯南发现一个可疑的男人，那个男人说是儿子被绑架而身怀赎金。柯南等为了探听详细的情况尾随那个男人到了他家，后来又接到了奇怪的暗号……
小五郎等到外面的店吃完饭时，遇到了大学时代的同学。因为有事商量，他们一同到了大村的公寓。在屋里喝茶说话时，窗户玻璃突然碎了，楼下的马路上有个男人倒地身亡。
大叔的师傅突然出现在事务所。有剧团因为被恐吓而委托小五郎去查看，兰和柯南也一起去了。舞台表演中，女主角演员大出被杀害了……
小五郎等人代替感冒的阿笠博士到伊豆参加推理之旅。活动规定，如果能够找出推理之旅的主办人就可以免费住宿，并可获得一个包含某种病毒程序的磁盘。不知什么人扮成暗夜公爵把柯南从栏杆上推了下去！
不知什么人扮成暗夜公爵把柯南从栏杆上推下去！小五郎等人去参加伊豆推理之旅。当晚，带着假面的江原从饭店楼上坠楼！警察认为是意外死亡。这真的只是意外吗？而后有个暗夜公爵打扮的人出现在柯南面前。
警察认为是事故死亡。而后有个暗夜公爵打扮的人出现在柯南面前。然后，兰怀疑扮成暗夜公爵的人是前田，想起了新一以前说过的话。柯南推理出杀害江原的凶手就在这次参加推理之旅的客人之中！究竟是谁？？？
小五郎在散步的途中，听到惨叫而赶过去看，一个男人痛苦死亡。后来得知那个男人在纠缠死亡现场附近的一位女子……
园子邀柯南与小兰至家中别墅度假，富泽财阀的别墅也建在旁边，园子和富泽家的三公子订有婚约。当晚，发生停电，而向外看时，正好目击到富泽的父亲被杀害的现场，小兰亲眼目睹了凶手的面貌，但嫌犯竟是死者的儿子，且三人长得一模一样……
柯南、小兰与少年侦探团成员一起至海边游玩，无意间遇到一对男女朋友，由于其男友的行径古怪，令人感到怀疑；观察力敏锐的柯南，看出一起谋杀计划正悄悄的进行，到底谁是凶手预定杀害的目标，少年侦探团亦被卷入谋杀案中……
小五郎一行人去观看了电影《死神阵内》。出演死神阵内的南条隼人接到了要来取他性命的预告函。小五郎接受其妻委托到事务所保护南条……
小五郎打麻将三缺一，打算叫喜欢麻将的肥田出来。可左等右等肥田都没出现，因此决定到肥田的金融公司去看个究竟。当他们到达肥田的住所时却发现肥田已经死亡……
铃木家收到了怪盗基德发出的要来偷取将在米花博物馆展出的黑珍珠的预告函，并且还发出时间、地点、通知函，行径非常嚣张。企业集团董事长感到非常慌张而拜托毛利小五郎侦查此案，宝物在警方重重戒备保护之下，怪盗要如何避开警方的封锁，下手盗取宝物？柯南解读了预告函向怪盗基德的现身地冲去。其后，基德又发出一封要在游艇宴会上偷取黑珍珠的预告函……一场名侦探VS怪盗的好戏即将展开……
铃木家收到了怪盗基德发出的要来偷取将在米花博物馆展出的黑珍珠的预告函，并且还发出时间、地点、通知函，行径非常嚣张。企业集团董事长感到非常慌张而拜托毛利小五郎侦查此案，宝物在警方重重戒备保护之下，怪盗要如何避开警方的封锁，下手盗取宝物？柯南解读了预告函向怪盗基德的现身地冲去。其后，基德又发出一封要在游艇宴会上偷取黑珍珠的预告函……一场名侦探VS怪盗的好戏即将展开……
小五郎接受了长门集团会长长门道三寻找初恋情人的委托，来到长门家。正好遇上会长老朋友服部平藏也在那里。在会长寿辰上，其子秀臣和日向幸订下婚约。
柯南在河边发现了一具尸体，确定是他杀，尸体肯定是因为杀死后扔进河里，在案发的时候发现了光明显示，展开调查。
受小五郎之托，柯南、小兰和园子来到银行。抢匪冲进了银行，并向银行职员开了枪……
少年侦探团把一名丧失记忆的画家送进了医院。其后，少年侦探团在空地上玩耍时却发现了那名画家的尸体……
高山南和永野椎菜的演唱组合「TWO-MIX」开现场演唱会的那天，在演唱会场的武道馆玩的少年侦探团遇到了人气偶像高山难，那时就在柯南他们的面前，高山南被绑架了……
柯南假扮步美追踪到了犯人所在的仓库，发现歹徒所要求交赎的物品中有一张神秘的乐谱，乐谱中的歌词竟然牵扯到一件杀人灭口的阴谋，而少年侦探团的其他成员却被另一名犯人抓住，在这危机时刻，犯人掏出了手枪……
因为脚骨折而住进医院的小五郎夜夜目击了一个杀人现场。但是因为没有发生杀人事件，小五郎的目击被当作幻觉。终于有一个晚上，杀人事件发生了……
园子、小兰和柯南一同上山滑雪度假，恰巧在别墅中遇到以前帝丹小学的班主任老师一起在别墅里过夜。入夜后的山上风雨交加，交通困难，别墅中园子和老师却遭到凶手连续的攻击，而且，在玄关的外面发现了遗体。
正当柯南进行调查时，又发生了谋杀案，有下田先生在内的几个人被杀害了。凶手的杀人计划似乎继续进行着，手写的MI NA KO的字样，犯人仍然在别墅里。别墅中所有的人正陷入极端的危险之中，小兰阻止了犯人……
在光彦的窃听器上听到了一段听上去像是绑架事件的对话。于是少年侦探团马上根据窃听器开始寻找犯人的所在……
小五郎他们为了看丹顶鹤去了北海道。在看丹顶鹤认识了町田修造，住到了他家。他的家里人为了遗产分配而争吵，然后町田被杀害了……
柯南与毛利小五郎等人受名小说家虎昌先生委托调查其妻子的外遇事件，小五郎去了被称为吸血鬼山庄的虎昌家。小五郎在那里留宿，不料在书房发生了密室杀人事件，虎昌先生突然惨遭杀害。由于凶案现场外积雪已深，却未留下任何脚印，使得案情疑云重重。
通向书房的走廊是不可能通过的，因为有人走过的话柯南他们一定会知道。而且因为雪已经停了，也没有脚印。犯人是怎样到书房的呢？在大家都将凶嫌箭头指向搞外遇的妻子和情夫时，柯南却看出破绽，一桩多年前的恩怨，埋下了愤恨的杀机……
冈野利香的世界艺术大奖的获奖庆贺Party上小五郎也在被邀请之列。在那几天前，冈野利香曾收到恐吓信，结果在那里发生了杀人事件……
小五郎因为腿骨折住进了医院。隔壁病床来探望父亲的儿子关根行动很可疑。柯南推理出了关根是因为女儿被绑架遭到了胁迫。同房间的另一个人的真实面目又是什么呢？
潮文造雇用职业杀手——银狐来暗杀自己，以提高知名度，事后却发现自己已经身患癌症。于是千方百计托人寻找银狐希望能够取消暗杀计划，可是却一直无法联络上银狐。潮氏委托小五郎保护，并抓到银狐。然后第二天，柯南他们就陪同潮一起去登山。平井被杀害了。
潮氏拜托毛利小五郎出面并设计一次爬山活动，希望能抓到银狐。毛利一行人于是参加这次恐怖的爬山行动，结果竟然有人惨遭杀害，但死者却不是潮文造。小五郎也遭到袭击，三枝也被杀了。背包里留下了一捆钱！柯南开始推理这个不可思议的时间。银狐的真面目到底是谁呢……
柯南与毛利侦探一行人至山上滑雪，意外遇上电影女明星明子和洋子，而偕伴同行。途中竟碰上传说中的雪女，所有的人均惊讶万分。此时女明星明子竟留下遗书自杀身亡，令人百思不得其解。而整个案子正将以自杀结案时，柯南却看出破绽，一件故布疑阵的杀人事件之事实真相缓缓浮现……
小五郎和多年不见的老朋友一起出去喝酒，回家的途中遇上了在事务所楼下咖啡厅见过几次面的岛村佐知子。之后佐知子邀请小五郎一起去兜风。当他们来到佐知子的住所时，却发现她的室友竹中和美被杀了，佐知子因为和小五郎去兜风所以有了不在场证明……
魔术师九十九元康的妻子来到了小五郎的事务所。她觉得1个星期前被认为是自杀的丈夫是不可能自杀的，希望小五郎尽快调查现场………柯南在那里看到了有暗号的memo和被牌遮住的电话推理出了真正的犯人。兰在看到以前的影集时发现柯南和新一小时后一模一样。相信柯南就是新一所以把柯南带到了新一家门口！
魔术师九十九元康的妻子来到了小五郎的事务所。她觉得1个星期前被认为是自杀的丈夫是不可能自杀的，希望小五郎尽快调查现场………柯南在那里看到了有暗号的memo和被牌遮住的电话推理出了真正的犯人。兰在看到以前的影集时发现柯南和新一小时后一模一样。相信柯南就是新一所以把柯南带到了新一家门口！
相信柯南就是新一所以把柯南带到了新一家门口！正在这个时候有希子回来了。次日柯南和有希子一起去了有希子的同学薮内家，薮内家正在为了遗产而起纷争。这次解决案件的却是……
相信柯南就是新一所以把柯南带到了新一家门口！正在这个时候有希子回来了。次日柯南和有希子一起去了有希子的同学薮内家，薮内家正在为了遗产而起纷争。这次解决案件的却是……
收到市川产业的会长的委托而且参加了在会长家开的party的小五郎他们，为了确定公司的继承人调查了会长的女儿们。这个时候会长倒下死了……而且是因为一直以来的心脏病突发而死的……真的是这样吗？
小五郎他们接到了陶艺家的菊右卫门说“到我家来一次”的电话， 为了让小五郎看他的新作“风水丸”，土屋益子（菊右卫门的儿媳）去仓库拿的时候不小心打破了。第二天早上，从仓库里传出了陶器的破碎声，大家跑过去的时候发现土屋上吊死了。
土屋益子虽然被认为是因为打破了“风水丸”而自尽的，柯南在看到现场的血迹时觉得奇怪，于是开始推理出犯人。凶手究竟是用什么手法杀人的呢？
去新一家大扫除的兰和园子和柯南。在那里碰到了来找新一的中学时代的学姐内田麻美。因为召开推理研究会，所以连小五郎都被邀请了。那天晚上别墅发生火灾，而别墅中只留下了麻美学姐一个人。
小兰把麻美学姐从火灾的别墅里救了出来，这是自杀吗？柯南在火场中发现可疑的证据，推敲这应该是一件蓄意纵火案。随后麻美从医院里消失了，麻美学姐是新一的初恋吗？园子和小兰开始介意了……
古装片的演员土方邀请小五郎他们到自己的家中，想请教做侦探的心得。不料就在他们走到阳台上时土方的妻子从冲田的房间里倒地死亡了。
在走到阳台上的时候隔壁的冲田的房间里电话响了，然后一个人从冲田的房间里倒了出来。竟然是土方的妻子！已经被勒死了。由于土方的妻子被发现是在冲田的房间里被勒死，遂认为是冲田杀害的，但柯南察觉到土方在电梯中的奇怪行为，于是向楼上走去，竟然发现了跟土方的房间一模一样的房间……
小五郎收到了一封由【中村操】寄来的信，说是作为遗产得到的房子里发生了奇怪的事情。例如一起在同一时刻11点鸣叫的电子钟、还有固定在桌子上的镜子等等。还有那个有斑鸠跳出来的钟是不祥之物吗？那个斑鸠钟里出来了三个小鬼。
1点10分，斑鸠钟里出来了三个小魔鬼雕像。柯南在这个房子找到了更多各种各样的隐藏着谜团的装饰。到了上午11点时，这个别墅里所有的时钟同时一起响起，出现了一连串不寻常的现象，而且在房顶的里面的房间里发现一个“生物”……而柯南发现纹时郎先生就是当年窃盗集团的老大……
小五郎他们被邀请参加颁奖仪式。认识了摄像师柳濑和记者中井。那天晚上接到了中井的电话，说到有人要杀他的时候电话突然断了。柯南他们赶过去的时候发现中井的家发生了火灾，而且中井从窗户里掉了出来！
柯南和元太一行四人因为到建筑工地里打棒球意外的认识了情绪阴晴不定的绵贯先生，而他牵扯到一桩杀人埋尸案。死者的哥哥幸田先生为了找到妹妹的尸体无所不用其极。幸田来到了小五郎的事务所请求调查妹妹的失踪。他妹妹自从晚上去了棉贯家就再也没回来。小五郎认为由于毫无证据在法律上很难成立。
原来幸田把从宝石店里偷来的宝石分散埋在了绵贯家的院子里。所以谎称妹妹的尸体埋在那里，让警察挖掘院子找出宝石。但警察挖掘后并没有发现尸体。于是侦探团开始了重新调查。幸田的计划能成功吗？柯南能适时揭发杀人埋尸案的真相，并找出尸体的下落吗？
步美被车撞了后那辆车逃跑了，柯南们在追踪那辆车的时候感觉那辆车的样子很可疑。之后犯人去自首了，但是在附近发生了杀人事件。据警方调查，那辆车的司机是被害者的公司的以前的职员……
园子因有事无法去上法国料理课，于是拜托兰去学习。同时把小五郎和柯南也带去了。不料在学习料理时突然停电了。就在再度打开电源时却发现料理的老师背后被像针一样的东西刺了一下，发了心脏病，倒地不支……
料理老师被送到医院后不治死亡了，因成了杀人案件于是报了警。经调查，发现凶器是直径1毫米以下的细针，刺进被害人背部，穿过肺部，导致其呼吸困难而死亡。柯南最终了解了犯人在黑暗中如何能刺进被害人的背后，且凶器又藏在哪里的作案手法。
柯南上学的小学里有人体模特儿在跑步等等的恐怖的留言。步美也看到了奇怪的人影。少年侦探团在夜里潜入了学校了，查清了奇怪的人影的真实身份……
因小五郎迷路，柯南和兰在有白色海滩的镇上过夜，没想到在海里发现了淹死了的女性尸体。小五郎觉得验尸的医生很可疑，但医生当时正和小五郎在一起，拥有完美的不在场证明。
兰突然撮合父母去伊豆游玩，但是样子很奇怪。原来是安排了英理和小五郎的见面。一行人在当地认识了一群来潜水的大学生，其中一人在海里溺水了，而一起去营救那人的小兰在溺水的地方发现了海蛇。
被海蛇咬到的贵和子伤势很严重被送到了医院。看上去像是不小心被海蛇咬到导致溺水的意外事故，但是柯南推理这是一起故意杀人事件。另一方面，小五郎非常认真地和英理说“等一下我有话和你说”。
名推理小说家的女儿委托毛利小五郎帮忙她寻找自己以失踪了2个月的父母亲，由于突然失去音讯，也未接获任何勒索电话，更奇怪的是柯南他们在出版社里却看到连载中的小说的原稿依然能按时地传真过来，使得案件更加扑朔离奇。
原来原稿里藏着暗号，在柯南和服部平次对小说内容的暗号仔细推敲之后，竟发现作者在文字之中透露出自己被监禁的地点。柯南解开了谜团后又把麻醉针射向了小五郎……
服部平次邀请柯南与毛利和小兰至大阪参观，一行人在旅行途中遇上一件离奇坠楼死亡事件。在柯南与平次对案情细心的推敲下，竟发现此案与另外两件杀人案件有密切关连。在整个案情指向一位女关系人时，她却惨遭灭口，案情越趋险恶、复杂……
服部平次邀请柯南与毛利和小兰至大阪参观，一行人在旅行途中遇上一件离奇坠楼死亡事件。在柯南与平次对案情细心的推敲下，竟发现此案与另外两件杀人案件有密切关连。在整个案情指向一位女关系人时，她却惨遭灭口，案情越趋险恶、复杂……
小五郎、兰和少年侦探团参加了一群热爱假面超人的大学生们举办的化妆聚会。在聚会的地方小五郎他们的面前，突然出现了一个男子开了枪，随后那个男子也举枪自尽了……
小五郎被山崎社长邀请去拍摄宣传广告。在吃饭喝酒的时候听到玻璃破碎的声音，跑过去看的时候发现社长从窗户里掉出来摔到悬崖下死了，房间竟然是密室状态！死因真的是因被大量蜜蜂追赶而不慎掉入山谷的吗？
柯南他们去看冲野洋子的现场演唱会的时候小五郎把票子弄丢了。在饭店里认识的女子说愿意出让多余的票子，但是想借用毛利的车去接妹妹。回到家里的时候妹妹在密封的浴室里自杀了……
警察认为这是密室自杀。另一方面柯南确信凶手就是姐姐。总觉得有什么不对的柯南，在看到门上的血迹以后找到了姐姐就是凶手的证据……
少年侦探团听了毛利侦探事务所的电话留言后，因为小五郎不在，所以他们自己去了日売电视台的天气预报小姐那里。发现那位天气预报小姐被绑架了，柯南从寻呼机上的信息找到了线索，于是开始着手调查。
受邀请到岩之风房间参加优胜庆祝会的小五郎他们，受石本的委托调查恐吓信的事情。当众议院的高田站到聚光灯下时，子弹擦过了石本射中了高田。
保护石本的小五郎接到报告说发现了可疑男子的尸体。小五郎和目暮警官去询问石本。柯南也为了发现真正的凶手溜进了石本的公司。
小兰的班级转来了伊东玉之助。小兰、园子和少年侦探团去参观后台的时候却在排练的时候发生了杀人事件。
柯南和小惠晚上追踪离开旅馆的玉之助，进入剧场一看玉之助倒在那里，荻原却因为高处坠落摔死了。
小五郎他们去银行，柯南看到了抢劫运钞车的强盗，强盗逃走了。然后，在河边发现了逃走的车子。有疑问的柯南去了银行职员广田雅美的家。
柯南的班级转来了灰原哀。隔壁班级的一个男孩因为哥哥下落不明而来委托少年侦探团。寻找的时候发现了一个黑衣女子的身影………那个组织的真面目到底是？然后，博士和会员和柯南去广田教授家拿软盘，可是……
柯南的班级转来了灰原哀。隔壁班级的一个男孩因为哥哥下落不明而来委托少年侦探团。寻找的时候发现了一个黑衣女子的身影………那个组织的真面目到底是？然后，博士和会员和柯南去广田教授家拿软盘，可是……
柯南的班级转来了灰原哀。隔壁班级的一个男孩因为哥哥下落不明而来委托少年侦探团。寻找的时候发现了一个黑衣女子的身影………那个组织的真面目到底是？然后，博士和会员和柯南去广田教授家拿软盘，可是……
柯南的班级转来了灰原哀。隔壁班级的一个男孩因为哥哥下落不明而来委托少年侦探团。寻找的时候发现了一个黑衣女子的身影………那个组织的真面目到底是？然后，博士和会员和柯南去广田教授家拿软盘，可是……
少年侦探团们去国立体育场看足球比赛。转播足球赛的日卖电视台受到了不知道是什么人打来的恐吓电话，勒索钱财。体育场的所有观众都被当成了人质。
警察们拼命的想早一刻找到犯人，但是没有发现。少年侦探团也参加了调查可疑人物。柯南在看直播的录像时觉得有什么不对的地方，找到了犯人所在的地方。
园子为了和网上认识的魔术爱好者联盟的人见面，和小兰一起出去了。小五郎和柯南送走了小兰，但是在车上的收音机里听到魔术爱好者联盟的头领被杀害的新闻，柯南回到了小兰的身边。
旅馆里被杀害的浜野的尸体旁边没有足迹。然后在和一个叫影法师的人聊天时，他却说“那个魔术师的死都是因为你们”……
浜野的尸体边上没有留下足迹，但是柯南发现了红酒的塞子后识破了凶手的诡计。然后正当要揭穿另一个人的真面目的时候……
步美在经过妈妈常去的绿美容院门口时，绿和美香正在争吵。美香邀请步美他们到自己的家来说可以帮他们理发。第二天到了美香的公寓的时候……
博士和少年侦探团去露营的时候看到了一座城堡，被招待入内。这座城堡据说是老主人留下的，有很多谜。柯南对于房间的隔断发生了怀疑，消失在墙壁中间……
博士和少年侦探团去露营的时候看到了一座城堡，被招待入内。这座城堡据说是老主人留下的，有很多谜。柯南对于房间的隔断发生了怀疑，消失在墙壁中间……
少年侦探团去看大怪兽歌美拉的电影。因为那个电影院已经决定关闭了，所以没什么客人。看电影的时候发现画面上有影子，回头看的时候有个男子上吊死了，而尸体在摇晃。
因为看电影的人很少，所以没有可疑人物。上吊的张田被认为是自杀。但是柯南试用某个东西和博士一起说明了杀人的手法。
因为感冒一个人留在家里的步美家来了强盗。因为感冒无法出声的步美连电话也不能打，想用侦探徽章告诉柯南他们但是没有成功，被强盗发现了。
平次的妈妈的同学，森园家的儿子的结婚仪式上，平次和和叶出席。到了东京后碰到了柯南他们，偶然遇到的森园家的管家也邀请了柯南他们。
然后发生了杀人事件。森园家的管家被杀害了。是密室杀人。柯南和平次认为来寻找杀人凶器的人就是凶手。那天晚上，住在森园家的柯南和平次采取了某个行动。
柯南、小兰和园子去长野观测天象。碰到了东都大学的研究生。半夜在观测天象的时候，有一个研究生从观测地点摔了下来……
小五郎收到了以前认识的旗本夏江寄来的北斗星号的票子和信，邀请他们去北海道。在北斗星号的列车上发生了杀人事件，柯南总觉得在哪里看到过。
乘客中的叫明智文代的女乘客的真实面目是？柯南揭开了列车作案的手法。那么，某个人阻止了犯人的魔手，这俩上野出发的北斗星3号的结局究竟如何？
作为青色古堡的探险事件的参考人，博士和少年侦探团被叫到了警视厅。随后2亿元抢劫事件的受害人东都银行的增尾行长也来了。增尾给在家的妻子打电话时，电话的那头传来了惨叫声。
马上赶到增尾家时发现增尾的妻子已经被杀害了。是被什么人从背后刺中而死亡的增尾的妻子。柯南却从中发现了疑点。然后分析出了杀害的方法。另一方面喜欢佐藤警官的高木警官却想到了其他的事情。
少年侦探团在星期天的早晨，去米花乐园的时候坐了陆上电车。过了一会儿，电车急刹车，乘客的一个人因为急停的关系死亡了。
小五郎带着兰和柯南去日卖乐园。兰对小五郎说只要小五郎蹦极就可以去赌赛艇。但是那个蹦极出事了。
小五郎去以前做过家庭教师的学生的家里。小兰和柯南也一起去。在到了他家附近的时候，学生的妹妹开的车爆炸了，当场死亡。柯南和小五郎开始推力这个突发事件。
惠清楚地记得一个可疑男子的容貌。了解了那个男子和惠的丈夫的关系后，其实死亡的本该是惠。然后明白了事情的真相。
小兰和园子在坐公共汽车的时候，小兰的旁边坐着一个谜一样的老人。醒过来的小兰在确定了和老人碰见的事情不是梦以后，带着柯南一起开始寻找老人的去向。
柯南、小兰和园子去伊豆游玩，但当地却传出有变态男子连续杀害褐色头发女生的事件。就在夜里，园子突然遭到不明男子的袭击，随后在车子里睡着的园子也差点掉到了悬崖下。
一直出现在现场的是一个奇怪的青年男子和长头发的男子。然后犯人用刀指着园子。
小五郎他们被叫到当初小五郎住过的公寓的房东家里。房东说想让小五郎和他的孙子谈谈。去他孙子的房间时敲门没有回答。用备用钥匙打开门后发现孙子已经在密室中死了。
佐藤警官和高木警官在押送嫌疑人的时候被犯人逃走了。好容易追上犯人的时候佐藤警官铐错了手铐，被留在了美术馆的厕所里。高木警官和少年侦探团为了找出真的犯人开始了秘密调查。
就在高木警官和侦探团在搜查犯人的时候，佐藤警官和嫌疑犯所在的美术馆竟要用博士发明的炸药爆破拆除掉，此时距离爆破的时间不到几分钟了……
星期天小五郎他们坐环状线时，遇到了休息天上班的广告公司的职员们。随后发现广告公司里一名早走的职员死在了车厢内……
小兰在抽奖时抽中了伊豆的旅行。和柯南及小五郎一起去了伊豆。去参观五重塔的时候听到了恐怖的传说。第二天，前一天晚上一起吃晚饭的小田在五重塔上被杀害了。
ODA旅行社的社长小田被杀害了。他杀不太可能，但是自杀也有很多的疑点。柯南确信是他杀，最终他从犯人说错的一句话中找出了罪犯。
小五郎他们去一个用船来上菜的餐厅吃饭。隔壁的房间是大学的教授，比较吵。过了一会儿服务员发现房间里的一个大学教授已经被刀刺死了。凶手是在不引起他人注意的情况下犯了案，最终柯南解开了真相……
阿笠博士抽奖抽中了旅行券，于是小五郎、小兰和侦探团去了冲绳，在飞机上小兰梦见了以前和新一一起去洛杉矶时在飞机上发生的杀人事件。那么这就是新一最初的一页……
阿笠博士抽奖抽中了旅行券，于是小五郎、小兰和侦探团去了冲绳，在飞机上小兰梦见了以前和新一一起去洛杉矶时在飞机上发生的杀人事件。那么这就是新一最初的一页……
博士为了让侦探团去寻宝，带大家去了年轻的时候死去的伯父的别墅。为了找到博士藏起来的宝贝，少年侦探团们依靠房间里隐藏的暗号逐渐解开了谜题。
博士准备的玩具被某个人破坏了。柯南开始解开别墅中另外隐藏着的暗号。然后找到了意见隐藏的房间，进去看时……
柯南为了在同学会上表演木偶剧，去雾之丘的旅馆排练。在那里孩子们一个一个消失了。步美和元太也消失了，终于柯南也消失了，只剩下光彦一个人。
平次和和叶在去鸟取县的武田家的途中迷路了。在那里遇到了一样是去武田家的外国人罗伯特。小五郎也因为偶然接到了委托坐车去的时候正好碰到了他们，大家于是一起去了武田家。
到了武田家的时候，一个叫根岸的男子已经死亡，希望他们能找到凶手，当天晚上委托人武田信一也被吊死了。听到了关于蜘蛛神的传说后，小五郎和平次去勘查现场。另一方面找东西的和叶和小兰在去仓库的途中，小兰回房间的时候，和叶被气枪袭击，在仓库的房间里被绳子吊了起来。
柯南和平次看穿了利用传说中的蜘蛛神的说法犯罪的手法。然后，三年前自杀的美沙的真正的理由是……
小五郎从米花水族馆的林先生那里得到赠券，去看在水中和鱼一起表演的演出。在女主角大泽出场的时候，已经淹死的她出现在了水槽里。
小五郎被邀请和家人一起到医生的家里吃晚饭。柯南和小兰也去了。当天晚上医生洗澡的时候突然停电了。在推上阀门去浴室看的时候，医生已经死了。
柯南注意到了在停电的时候小兰抓住了医生的儿子新出智明的手，而且表情很不自然。柯南了解了事情的真相后和大家说“等到小五郎从浴室出来的时候就开始推理秀”
柯南和小兰和园子在溜冰场认识了飞碟射击爱好者们。在等待晚上的焰火的时候，园子等在清扫中的厕所的门口，打开门进去的时候发现一个女子已经死在里面。
死者是社长千金伊丹千寻，鍳识人员发现在喷满血迹的墙上有怀疑是【S】的标记，柯南最终解开了谜题……
小兰在看到去小笠原参加免费海豚旅行的广告后，报名参加了。乘客中据说有当年蛟崎和小五郎一起追捕过的影子计划师叶才三。然后服部收到了叫古川大的人寄来的信，也参加了这个旅行团。后来船上发生了爆炸，那个被烧死的男人是……？并且企图解开谜题的平次也被人袭击了。
小兰在看到去小笠原参加免费海豚旅行的广告后，报名参加了。乘客中据说有当年蛟崎和小五郎一起追捕过的影子计划师叶才三。然后服部收到了叫古川大的人寄来的信，也参加了这个旅行团。后来船上发生了爆炸，那个被烧死的男人是……？并且企图解开谜题的平次也被人袭击了。
小兰在看到去小笠原参加免费海豚旅行的广告后，报名参加了。乘客中据说有当年蛟崎和小五郎一起追捕过的影子计划师叶才三。然后服部收到了叫古川大的人寄来的信，也参加了这个旅行团。后来船上发生了爆炸，那个被烧死的男人是……？并且企图解开谜题的平次也被人袭击了。
小兰在看到去小笠原参加免费海豚旅行的广告后，报名参加了。乘客中据说有当年蛟崎和小五郎一起追捕过的影子计划师叶才三。然后服部收到了叫古川大的人寄来的信，也参加了这个旅行团。后来船上发生了爆炸，那个被烧死的男人是……？并且企图解开谜题的平次也被人袭击了。
小五郎受静冈县横沟警官的委托去了静冈。案件是演员小宫山在乐屋被杀害，而承认杀人的得有三个人。
柯南和小哀在放学的途中看到了和琴酒的车一样的车……柯南在车上放了窃听器。车子的主人果然是琴酒。窃听器被琴酒发现后毁掉了。仅仅留下了在杯户城市酒店会有什么事发生的线索。于是柯南和小哀去了杯户城市酒店。
柯南和小哀去了杯户城市酒店。杯户城市酒店内举办的酒卷昭的怀念会上发生了杀人事件。柯南找到了犯人的线索。但混杂在人群中的哀却被什么人带走了！
慧媛告诉工藤知道细胞生殖的问题，如果不处理了，估计这辈子都无法和工藤在说话了。
阿笠博士邀请少年侦探团去咖啡厅喝茶，柯南注意到了后面进来的客人大原企画社长大原一雄和原大原企画的设计师相田彻的交谈。
娱乐集团的会长加那善则因为妻子收到了恐吓信而委托小五郎来调查。接受委托的小五郎他们隐藏了侦探的身份出席了宴会。主角杰拉尔·天马迟到了。之后，房子停电了，加那善则的妻子发出了惨叫声。
晚到的杰拉尔·天马被剑杀死，和天马有过争吵的加那善则很可疑。柯南揭穿了像谜一样的人物的真面目，同时也解开了杀害天马的凶手所用的犯罪手法。
少年侦探团在放学的途中发现勾在S形钩子上的结婚戒指。光彦说这是某个人的SOS的求救信号，开始搜索现场正在建的公寓。
少年侦探团在超市里玩从收银条上的物品名称猜晚饭的菜名的游戏。其中发现了可疑的收银条，柯南她们开始寻找买这些东西的人，想要阻止他。
小五郎他们去参加为了交通事故的孤儿们的慈善活动，被邀请到发起者的社长家里。社长的苏芳红子在收集面具。连被称作被诅咒的假面的面具也用来装饰。为了不让这些面具出来作怪，晚上0点就会把这件假面之屋锁掉。当天晚上苏芳红子在自己的卧室被杀害，卧室上了两道锁，处于密室状态。同时在苏芳红子的尸体周围被诅咒的假面散落了一地。这真的是诅咒吗？
小五郎他们去参加为了交通事故的孤儿们的慈善活动，被邀请到发起者的社长家里。社长的苏芳红子在收集面具。连被称作被诅咒的假面的面具也用来装饰。为了不让这些面具出来作怪，晚上0点就会把这件假面之屋锁掉。当天晚上苏芳红子在自己的卧室被杀害，卧室上了两道锁，处于密室状态。同时在苏芳红子的尸体周围被诅咒的假面散落了一地。这真的是诅咒吗？
小五郎和兰和柯南住进了建在山里的山庄。在那里住宿的客人中有“城市猎人”节目的演员砂冈和工作人员。小五郎和大家一起去烧烤，不久听到了枪声，砂冈被杀害了。凶手竟是从对面的悬崖开的枪。
砂冈被枪杀了，来福枪在山里被发现所以认为是外部的人干的。但是有疑点，明白山庄里的人物也可以杀人后，柯南发现了散落的玻璃碎片，明白了犯罪的手法。
小五郎接受电视节目制作公司社长古川悦子的委托去保护他的母亲。然后在古川家等待悦子回来的时候知道了家属和女佣之间发生了很多金钱上的纠纷。悦子回来后去母亲的房间叫母亲时从母亲的房间传来了枪声。悦子的母亲被击中头部死亡。
和阿笠博士去露营的少年侦探团们。柯南他们去拾柴，发现了一个山洞，进去一看碰到了正在搬运尸体的可疑男子，柯南被犯人的枪射中了。少年侦探团受到了前所未有的威胁。
把重伤的柯南背在背上的侦探团们根据洞里的暗号开始寻找出口。好容易找了出口后，犯人追了出来被正好赶来的目暮警官们带走了。柯南被迅速送到了医院。小兰确信了柯南就是新一，还输血给他，使柯南脱离了生命危险。
柯南正在为是否告诉小兰自己的真相而烦恼。当天夜晚，灰原出现在了柯南的病房并把枪口对准了柯南！同时小兰的学校正在准备文化节，柯南出院后也去看了小兰主演的话剧。但是观众中的一个男子突然倒下死了。死因是——氰酸钾！
在小兰主演的话剧的表演中，发生了杀人事件。原来由新出医生扮演的黑衣骑士却换成了……目暮警官认为被杀害的蒲田的饮料中被他的同伴们下了毒，但是从现实情况来说准备断定是自杀。此时意外的人物出现了！
新一的出现圆满解决了案件。变回原来的身体的新一回到原来的生活的时候，在米花中心大厦的瞭望餐厅邀请兰吃晚餐。晚餐时听说在餐厅的电梯里发生了杀人事件的新一对兰说“马上回来”，奔向了案发现场。
新一明白了在米花中心大厦的电梯里杀害社长的犯人，但是身体开始发生变化，另一方面小兰在瞭望餐厅一个人等着新一的回来。结果回来的却是柯南，新一约小兰来这个餐厅有什么特殊的意义吗？
小五郎的事务所里来了一个叫春菜的大学生，委托小五郎找他的寻呼机朋友。春菜保存了秋悟先生的寻呼机和音乐盒，那以后，春菜的寻呼机上出现了奇怪的留言。小五郎一行找到秋悟的家人，却发现秋悟已经死了。走廊上出现了奇怪的人影……
柯南明白了小兰看到的拄拐杖的老人的影子和埝被古琴殴打的真相。春菜收到的音乐盒里究竟隐藏着什么谜题？然后时价2亿日元的邮票究竟藏在哪里？？
园子和小兰差点被车撞了，由此认识了那个司机吉野千惠。听说她最近老是头昏，头痛。小兰总觉得很在意吉野夫妇的事情，该不会是为了得到保险赔偿而故意杀人吧。小兰的怀疑到底对不对？
小兰和柯南到酒店去接醉酒的小五郎，在回来的路上听到公寓居民那里传来了玻璃破碎和吵架的声音。第二天早上经过那个公寓时，发现吵架的居民已经被杀害了。柯南他们顺利地推理出了事件的真相。
工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。
工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。
工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。
工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。
工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。
工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。
工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。
工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。
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